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Ultra-Deep Microbiome Prep
Host DNA depletion and microbial DNAextraction from 1ml body fluids or0.25cm² tissue for Microbiome analysis
Ultra-Deep Microbiome Prep10
Host DNA depletion and microbial DNA extraction from 1-10ml body fluids or 0.25cm² tissue for Microbiome analysis
Ultra-Deep Microbiome Prep
Test Samples, 8 reactions
售價: 4000元
限購2組
最佳方案 Removal of Host DNA and Enrichment and Extraction of Microbial DNA for Next-Generation Sequencing
Body fluids: ascites, BAL, blood, CSF, pleural fluid, pus, synovial fluid
Tissues: abscesses, biopsies, heart valves, prostheses, stents
Ultra-Deep Microbiome Prep 適用在從≤1ml 臨床檢體中,萃取純化微生物 DNA 的全新解決方案。
Ultra-Deep Microbiome Prep 10 適用在從1-10ml 臨床檢體中,萃取純化微生物 DNA 的全新解決方案。
適用樣本包括:
流體樣本(例如,腹水、BAL、CSF、滑液)和組織樣本(例如,膿腫、活檢、天然/人工心臟瓣膜)。 可完成包括去除宿主 DNA (≥95%) 並從細菌和真菌中萃取純化 DNA,可應用於mNGS次世代定序病原基因檢測。
從人體取得感染檢體的mNGS應用,需要更高分辨率的微生物DNA樣本,為了獲得更精確的分析數據,必須盡可能的去除負面影響的因素。如下圖所示,很多負面因素都有可能影響最後的判讀結果。
在這些因素中,包含有操作過程中外來的干擾,也有是檢體本身的問題。最主要的負面因素,就是檢體本身的問題,特別是指人類 DNA 和細胞外 DNA,它們會在DNA擴增過程中與來自活微生物的目標DNA序列一起被擴增了。 此外,由於微生物群落可以由屬於非常多樣化的分類群的數百種物種組成,因此萃取純化過程必須更優化,保證從樣品中任何存在的微生物中取得DNA。 最後,被污染的萃取或放大試劑組,也會將外來汙染微生物 DNA 輸入到分析樣品中,這也會使分析產生偏差。
分析來自人體的微生物,無論是全基因組定序,或是靶向定序,都需要最高質量的目標 DNA。沒有做過前處理的檢體,含有大量人類 DNA 的複雜 DNA 混合物,而真正來自活微生物 DNA 的量也只是一小部分,甚至於隨著樣本的不同,活微生物 DNA的量也會隨著不同。 經過Ultra Deep Microbiome Prep 前處理過的樣本,保證可以提高臨床樣本中序列讀數的輸出解析度。
上述問題,您都可以透過Ultra Deep Microbiome Prep解決,Ultra Deep Microbiome Prep非常適合初學者使用,也非常適合剛開始要建立mNGS前處理步驟的實驗室。